El presupuesto de la Comisión durante el ejercicio económico del 2006 fue de 677.217, el del 2007 fue de 980.933 y en la proforma 2008 se registra 713.632. El incremento de 300.00 dólares en el 2007 se produjo por la asignación de recursos para la adquisición de las oficinas de Quito Honesto y para el funcionamiento de la Veeduría del proyecto del nuevo Aeropuerto de Quito.